甲状腺功能减退主要是由于甲状腺激素合成及分泌减少，或其生理效应不足所致机体代谢降低的一种疾病。据统计，人群中甲状腺功能减退的患病率约为1%左右，女性发病率高于男性。
自身免疫因素导致
自身免疫性甲状腺炎： 这是最常见的引起甲状腺功能减退的原因。比如桥本甲状腺炎，它是一种自身免疫性疾病，体内产生了攻击甲状腺的自身抗体，像甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）和甲状腺球蛋白抗体（TgAb）等，这些抗体持续破坏甲状腺组织，使得甲状腺不能正常合成足够的甲状腺激素。据研究，约90%以上的慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本甲状腺炎的全称）患者最终会发展为甲状腺功能减退。其他自身免疫性疾病关联： 一些其他自身免疫性疾病也可能与甲状腺功能减退相关，比如1型糖尿病患者中，合并甲状腺功能减退的比例相对较高，这是因为自身免疫机制在多个内分泌器官同时起作用，影响了甲状腺的功能。
甲状腺手术及放射性碘治疗相关
甲状腺手术因素： 当因甲状腺结节、甲状腺癌等疾病进行甲状腺部分或全部切除术后，甲状腺组织减少，合成甲状腺激素的量就会不足，从而引发甲状腺功能减退。如果是甲状腺全部切除，那么患者几乎完全丧失了甲状腺激素的分泌能力，需要终身补充甲状腺激素；如果是部分切除，剩余甲状腺组织的功能可能不足以维持正常的甲状腺激素水平，术后一段时间后也可能出现甲状腺功能减退的情况。放射性碘治疗因素： 放射性碘治疗常用于治疗甲状腺功能亢进症，放射性碘会破坏甲状腺细胞，导致甲状腺激素释放减少。一般在放射性碘治疗后数月至数年，部分患者会逐渐出现甲状腺功能减退的症状。有数据显示，接受放射性碘治疗的甲亢患者，10年内发生甲状腺功能减退的概率可达到40% - 70%左右。
药物及碘摄入异常因素
药物影响： 某些药物会影响甲状腺激素的合成或作用。例如，含碘的药物，像胺碘酮，长期服用可能会干扰甲状腺的正常功能，导致甲状腺激素合成障碍。还有一些抗甲状腺药物，在治疗甲状腺功能亢进时，如果使用剂量过大，也可能暂时或长期引起甲状腺功能减退。另外，锂剂等药物也可能通过不同机制影响甲状腺的功能，导致甲状腺激素分泌不足。碘摄入异常： 碘是合成甲状腺激素的重要原料，碘摄入不足或过多都可能引发甲状腺功能减退。碘摄入不足时，甲状腺合成甲状腺激素的原料缺乏，会导致甲状腺功能减退，这种情况在一些缺碘地区较为常见；而碘摄入过多时，虽然短期内可能不会立即出现问题，但长期大量摄入碘可能会干扰甲状腺的正常调节机制，也可能引发甲状腺功能减退，比如长期食用含碘量过高的海产品等。