早上起来手肿胀、手指关节疼痛，可能是以下原因引起：
1.类风湿关节炎：女性好发，多发生在35-50岁之间，典型表现为对称性、多关节肿胀、疼痛、畸形，早晨起床时手指发僵、握拳困难，常伴有晨僵，时间长短不一，轻者持续1-2小时，重者可持续整天。手指关节疼痛的同时，还可能伴有腕、肘、肩、膝、髋、踝关节疼痛。此外，还可能出现发热、贫血、皮下结节等表现。
2.骨关节炎：手的远端指间关节最常受累，也可累及近端指间关节、掌指关节、腕关节、肘关节、肩关节等。手指关节疼痛、肿胀，关节边缘有压痛，严重时可出现畸形。常伴有手指僵硬、麻木等症状。
3.痛风：痛风可侵犯手、足等关节，多在夜间突然发作，受累关节及周围组织红、肿、热、痛，疼痛剧烈，疼痛于24-48小时达到高峰。首次发作多侵犯单关节，部分患者可在一年内复发，受累关节一般在数天至2周内自行缓解，常伴有高尿酸血症。
4.其他：系统性红斑狼疮、干燥综合征、皮肌炎、硬皮病等也可出现手指关节疼痛、肿胀，应及时就医，明确诊断。
如果出现早上起来手肿胀、手指关节疼痛的症状，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。同时，应注意休息，避免劳累，避免寒冷、潮湿等刺激，可适当进行手部锻炼，如握拳、伸展等。