结肠炎的药物治疗需根据类型等因素决定，常用药物有氨基水杨酸制剂等。例如轻中度溃疡性结肠炎常用柳氮磺吡啶，一般起效时间可能需要1-2周左右。
氨基水杨酸制剂类药物
柳氮磺吡啶： 是治疗轻中度溃疡性结肠炎的常用药物，它在肠道内分解为磺胺吡啶和5-氨基水杨酸，5-氨基水杨酸可抑制肠道炎症。但部分人服用后可能出现恶心、呕吐等胃肠道反应。美沙拉嗪： 也是氨基水杨酸制剂，有肠溶片等剂型。它局部作用于肠道炎症部位，相对副作用可能比柳氮磺吡啶小一些，同样可能有少数人出现腹泻、头痛等不适。
糖皮质激素
泼尼松： 对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中重度结肠炎患者可使用。一般初始剂量根据病情而定，如轻度活动期可能起始剂量为每日10-40mg。但长期使用可能会引起向心性肥胖、骨质疏松等不良反应。氢化可的松： 重症结肠炎患者可能会静脉使用氢化可的松，起到快速抗炎的作用。不过长期大剂量使用也会带来如血糖升高、感染风险增加等诸多不良反应。
免疫抑制剂
硫唑嘌呤： 适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或依赖的患者，起效相对较慢，可能需要数月才能看到明显效果。使用过程中需定期监测血常规等指标，因为可能会引起白细胞减少等骨髓抑制的情况。巯嘌呤： 与硫唑嘌呤作用类似，属于免疫抑制剂，也需要关注血液系统等方面的不良反应，比如可能导致血小板减少等问题。