慢性疲劳综合征除了持续6个月及以上的疲劳感外，还可能有这些症状。患者常伴有睡眠障碍，约50% - 90%的慢性疲劳综合征患者存在睡眠问题，表现为入睡困难、睡眠浅、易惊醒等。还可能出现认知功能障碍，约有30% - 75%的患者会有注意力不集中、记忆力下降等情况，比如记不住刚发生的事情、难以集中精力完成简单任务等。另外，肌肉骨骼方面也会有症状，约75%的患者会有关节疼痛，多为非对称性、游走性的关节痛，还可能有肌肉无力，比如爬几层楼梯就感觉四肢无力等。
睡眠障碍表现
入睡困难： 慢性疲劳综合征患者往往很难顺利进入睡眠状态，躺在床上很久才能睡着，有的可能需要1 - 2小时甚至更久才能入睡。睡眠浅易惊醒： 睡眠质量差，稍微有点动静就容易醒来，醒来后很难再次入睡，导致整个睡眠过程断断续续，休息不充分。
认知功能障碍表现
注意力不集中： 在工作或学习时，很难长时间保持注意力，容易被外界干扰，比如在看书时，会频繁走神，无法专注于阅读内容。记忆力下降： 对近期发生的事情遗忘明显，例如刚和别人说完的事情，过一会儿就记不起来了，影响日常生活和工作交流。
肌肉骨骼症状表现
关节疼痛： 关节疼痛部位不固定，可能今天是膝关节痛，明天是肘关节痛等，疼痛程度不一，有的患者是轻微酸痛，有的则是较为剧烈的疼痛，活动时疼痛可能会加重。肌肉无力： 身体肌肉力量减弱，比如提重物时感觉力不从心，爬楼梯时腿部肌肉明显无力，影响日常的活动能力，导致行动较为迟缓。