嘴巴里面长溃疡的原因有多种，一般来说，复发性阿弗他溃疡较为常见，人群中约10% - 25%会受到其影响。
一、局部创伤因素
口腔内异物摩擦： 如果口腔里有残根、残冠，或者佩戴不合适的假牙，长时间摩擦口腔黏膜，就容易引发溃疡。比如残根边缘比较尖锐，不断刺激对应的黏膜组织，经过一段时间后就可能形成溃疡。咬伤口腔黏膜： 吃饭时不小心咬到舌头、颊部等部位，也会导致局部出现溃疡。这种情况在进食过快、注意力不集中时容易发生。
二、免疫系统因素
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现紊乱时，可能会攻击自身的口腔黏膜组织，从而引发溃疡。例如患有白塞病时，口腔黏膜会反复出现溃疡，同时还可能伴有眼部、生殖器等部位的病变。一般这种情况可能会持续较长时间，病情容易反复发作。免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如长期疲劳、睡眠不足、患有某些慢性疾病等情况下，口腔黏膜抵御外界病菌等因素的能力下降，就容易长溃疡。像感冒发烧期间，很多人会出现口腔溃疡，就是因为此时免疫力降低了。
三、营养缺乏因素
维生素缺乏： 缺乏维生素B1、B2、B6、B12以及叶酸等，都可能引起口腔溃疡。比如长期吃素的人，如果饮食搭配不合理，就容易缺乏这些维生素。以缺乏维生素B2为例，会导致口腔黏膜细胞代谢紊乱，进而引发溃疡。微量元素缺乏： 缺乏铁、锌等微量元素也与口腔溃疡的发生有关。铁是参与人体血红蛋白合成等重要生理过程的元素，锌与人体的免疫功能、细胞修复等密切相关。当体内铁、锌含量不足时，会影响口腔黏膜的正常修复和免疫功能，增加长溃疡的几率。