女性生殖器疱疹主要是由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起的，其中约90%由单纯疱疹病毒Ⅱ型（HSV-2）引起，10%由单纯疱疹病毒Ⅰ型（HSV-1）引起。
病毒传播途径
性接触传播：这是最主要的传播方式。与携带HSV的性伴侣发生无保护的性行为时，病毒可通过皮肤或黏膜的细微破损进入人体从而引发感染。在性活跃期的女性中，感染风险相对较高。母婴传播：患有生殖器疱疹的孕妇，在分娩过程中，胎儿通过产道时可能会感染HSV，导致新生儿患上新生儿疱疹，这会对新生儿的健康造成严重影响，如引起皮肤、眼睛、口腔等部位的感染，甚至可能累及中枢神经系统。
自身抵抗力因素
免疫力低下时易发病：当女性自身免疫力较低时，比如长期患有慢性疾病（像艾滋病等）、长期使用免疫抑制剂（如器官移植后服用的某些药物）、过度劳累、熬夜等情况，身体对HSV的抵御能力下降，就更容易受到HSV的侵袭而引发生殖器疱疹。例如，长期熬夜会使人体的免疫系统功能紊乱，从而增加感染生殖器疱疹的可能性。
其他诱发因素
局部皮肤损伤：女性生殖器部位如果有外伤、摩擦等导致皮肤黏膜破损，这时候HSV就更容易侵入。比如进行过于剧烈的性生活导致局部皮肤擦伤，就为HSV的感染打开了“大门”。激素变化影响：月经周期、怀孕等激素水平发生变化的时候，也可能促使潜伏在体内的HSV激活，从而引发生殖器疱疹发作。例如，在月经前期，女性体内激素水平波动较大，可能会使原本潜伏的病毒活跃起来，导致疱疹复发。