手足口病后指甲脱落，可能源于甲母质损伤，也可能因缺钙所致。以下详细说明：
一、甲母质损伤：
手足口病主要由肠道病毒感染引起，患者会有发烧以及手足口腔散落皮疹、疱疹等症状，严重者还会出现头痛、呕吐、肢体抖动、呼吸急促甚至危及生命。如果病情较轻，痊愈后通常不会有指甲脱落现象，但病情严重时会损伤甲母质从而导致指甲脱落，不过一般三个月左右会逐渐长出新指甲，无需过度担忧。
二、缺钙：
孩子若有挑食、偏食情况，可能导致体内营养不足，长期缺钙会致使指甲脱落。这时需要及时补充钙剂，同时服用维生素D辅助治疗，以加快身体对钙的吸收。平时一定要保证营养均衡，避免过度挑食。
总之，手足口病后指甲脱落的原因主要是这两种，要根据具体情况采取相应措施。