涎腺囊肿一般建议切除，尤其是较大的囊肿，若不切除可能会反复感染等。通常手术切除是主要的治疗方式，且手术相对简单。
囊肿较小的情况
无症状小囊肿：如果涎腺囊肿比较小，没有明显的不适症状，比如没有影响口腔的正常功能，也没有造成疼痛等情况，但是也需要密切观察。因为部分小囊肿可能会自行消退，但这种情况相对较少。不过如果观察过程中囊肿有增大趋势，还是需要考虑手术切除。
囊肿较大的情况
影响口腔功能的囊肿：当涎腺囊肿较大时，可能会影响口腔的咀嚼、说话等功能。例如，位于舌下的较大囊肿，可能会阻碍舌头的活动，影响正常的进食和言语表达，这种情况下一般建议尽早切除，以恢复口腔的正常功能。反复感染的囊肿：涎腺囊肿如果反复发生感染，会引起局部的红肿、疼痛等症状，给患者带来痛苦，而且反复感染可能会导致周围组织的炎症反应加重，这种情况下也需要进行切除手术，消除感染病灶。
儿童患者的特殊情况
幼儿涎腺囊肿：对于儿童患者的涎腺囊肿，需要谨慎对待。如果是幼儿的小囊肿，要观察其生长情况。如果囊肿影响了儿童的口腔发育或者有持续增大的迹象，也要考虑手术切除。因为幼儿的口腔功能正在发育中，较大的囊肿可能会对其未来的口腔功能产生不良影响。
手术切除的优势
彻底解决问题：通过手术切除涎腺囊肿，可以从根本上解决囊肿的问题，避免囊肿再次复发或者引起其他并发症。手术可以完整地去除囊肿组织，降低了病情反复的可能性。而且手术操作相对成熟，安全性较高，一般在局部麻醉下就可以进行手术，术后恢复相对较快。