肛门肿痛可能由多种原因引起。比如，痔疮发作时就可能出现肛门肿痛，尤其是内痔嵌顿或者血栓性外痔，疼痛可能较为明显。一般来说，痔疮引起的肛门肿痛如果是轻度的，可能会持续几天到一周左右。
痔疮导致的肛门肿痛
内痔脱出嵌顿： 内痔发展到一定程度，排便时容易脱出肛门外，如果不能及时回纳，就会引起肛门肿痛。这是因为脱出的痔核受到括约肌的夹持，静脉回流受阻，导致水肿、淤血。血栓性外痔： 通常是因为肛周皮下血管破裂出血，形成血栓，在肛门周围形成暗紫色圆形硬结，伴有剧烈疼痛，这种疼痛往往比较突然，让人坐立不安。
肛周感染引发的肛门肿痛
肛窦炎： 肛窦位于肛门瓣下方，形似小口袋，容易积存粪便和细菌，如果发生感染，就会引起肛门部的胀痛，尤其是排便时，疼痛可能会加重，还可能伴有肛门坠胀感。肛周脓肿： 是肛管直肠周围软组织内或其周围间隙发生的急性化脓性感染并形成脓肿。初期表现为肛门周围出现小硬块或肿块，继而疼痛加剧、红肿发热，随着脓肿的增大，疼痛会更加明显，有的患者体温还会升高，一般在38~39℃左右。
肛裂造成的肛门肿痛
排便时的剧痛： 肛裂是肛管皮肤的破裂或撕裂，排便时干硬的粪便通过肛管，会刺激裂口，引起剧烈疼痛，呈刀割样或烧灼样，排便后疼痛会有短暂缓解，但随后因肛门括约肌痉挛又会出现长时间的疼痛，同时可能伴有便血，血色鲜红，量不多。慢性肛裂的特点： 慢性肛裂由于反复感染，会形成前哨痔等，肛门肿痛会相对持续，且在排便后疼痛缓解后，因括约肌痉挛又会再次出现较明显的疼痛。
其他原因引起的肛门肿痛
肛门异物损伤： 如果肛门部位进入异物，比如鱼刺、竹签等，会引起局部的肿痛，通常有明确的异物进入史，能感觉到肛门处有异物存在的不适感，并且伴有疼痛。肠道炎症影响： 如溃疡性结肠炎累及肛门时，也可能出现肛门肿痛，同时还会伴有腹泻、黏液脓血便等症状，腹泻次数可能较多，每天可达数次到十多次不等。