耳朵下面长囊肿的常见原因有以下这些。一般来说，先天性因素可能是其中之一，比如鳃裂囊肿，它是胚胎发育时期鳃裂残余组织发展而成，在胚胎发育到第3周时就开始出现鳃弓，第5周形成鳃裂，若发育异常就可能形成囊肿。
炎症感染引起
局部皮肤感染：当耳朵下面的皮肤受到细菌等病原体感染时，反复的炎症刺激可能导致局部组织增生、积液等形成囊肿。比如平时不注意耳朵下面皮肤的清洁，容易沾染细菌，引发毛囊炎等，如果没有及时有效治疗，炎症持续存在，就有可能发展为囊肿。邻近组织炎症蔓延：周围组织的炎症也可能波及耳朵下面形成囊肿。例如口腔、咽喉部位的炎症，像智齿冠周炎、扁桃体炎等，炎症蔓延至耳朵下面的淋巴结周围，长期的炎症刺激可能使淋巴结周围组织发生改变，形成囊肿样结构。
皮脂腺囊肿
皮脂腺导管堵塞：耳朵下面皮肤中的皮脂腺导管如果被角质细胞等堵塞，皮脂腺分泌的皮脂就无法正常排出，逐渐淤积在导管内，从而形成囊肿。一般这种囊肿生长比较缓慢，刚开始可能只是一个小的硬结，随着时间推移，囊肿可能会逐渐变大。而且皮脂腺囊肿好发于皮脂腺分泌旺盛的部位，耳朵下面也是常见部位之一，通常与局部皮肤卫生状况有关，比如长期不清洁面部，就容易导致皮脂腺导管堵塞。
创伤因素
外伤后组织修复异常：耳朵下面如果受到外伤，比如磕碰、挤压等，在组织修复过程中可能出现异常，导致局部组织液积聚或者纤维组织增生等情况，进而形成囊肿。例如不小心被撞到耳朵下面，受伤部位在修复时如果过程不顺利，就可能形成囊肿样的结构。