治疗扁平疣常用的药膏有维A酸类药膏、水杨酸类药膏以及抗病毒类药膏等。一般来说，维A酸类药膏如0.1%维A酸乳膏可能会有一定效果，但具体哪种好需根据个体情况而定。
维A酸类药膏：
0.1%维A酸乳膏： 它可以调节表皮细胞的分化，促进角质层脱落，从而达到治疗扁平疣的作用。不过，使用时可能会有局部刺激症状，如红斑、脱屑等，一般在用药初期较明显，通常可以逐渐适应。但要注意，孕妇禁用该药膏，哺乳期女性使用时也需谨慎，避免药物通过皮肤吸收影响婴儿。1%阿达帕林凝胶： 属于第三代维A酸类药物，作用机制与0.1%维A酸乳膏类似，对扁平疣也有一定的治疗作用。它的刺激性相对较小，适合皮肤相对较薄或敏感部位的扁平疣治疗。不过，使用后也可能出现皮肤干燥、烧灼感等，使用时要避免接触眼睛、口腔等黏膜部位。
水杨酸类药膏：
水杨酸软膏： 水杨酸具有角质溶解作用，能促使扁平疣角质层脱落。它可以通过软化角质，帮助药物更好地渗透到病变部位，从而发挥治疗扁平疣的效果。但使用时要注意避免用于皮肤破损处，以免引起刺激疼痛。对于皮肤敏感的人群，使用后可能会出现局部发红、刺痛等不适，此时应暂停使用。复方水杨酸苯甲酸搽剂： 其中含有水杨酸等成分，也可用于扁平疣的辅助治疗。它能帮助去除角质，改善扁平疣的症状。但使用时要严格按照说明书使用，避免大面积使用，尤其是儿童要谨慎使用，防止药物过量吸收引起不良反应。
抗病毒类药膏：
5%咪喹莫特乳膏： 它是一种免疫调节剂，通过刺激局部免疫系统来发挥抗病毒作用，对扁平疣有一定疗效。使用时可能会出现局部炎症反应，如红斑、糜烂、结痂等，一般在停药后可逐渐恢复。但孕妇禁用该药膏，哺乳期女性使用时也需要咨询医生，且在使用过程中要避免药膏接触到正常皮肤。干扰素凝胶： 具有抗病毒和调节免疫的作用，可用于治疗扁平疣。它能抑制病毒的复制，增强机体的免疫功能来对抗病毒感染。不过，使用干扰素凝胶可能会出现局部瘙痒、灼痛等不良反应，使用时要注意观察皮肤反应，若出现严重不适要及时就医。