治疗扁平疣常用的药膏有维A酸类药膏、水杨酸类药膏等。一般来说，维A酸类药膏如0.1%维A酸乳膏可能对扁平疣有一定效果。
维A酸类药膏
0.1%维A酸乳膏： 它可以调节表皮细胞的更新，促进角质层脱落，从而发挥治疗扁平疣的作用，但使用后可能会有局部刺激症状，如发红、脱屑等，一般建议晚上使用。
水杨酸类药膏
水杨酸软膏： 水杨酸具有角质剥脱作用，能够帮助去除扁平疣表面的角质层，从而改善扁平疣的症状。不过，使用时要注意避免接触正常皮肤，以免引起刺激。
干扰素凝胶
重组人干扰素α-2b凝胶： 它属于免疫调节剂，通过调节机体的免疫功能来发挥抗病毒作用，对扁平疣有一定疗效。使用时需注意保持用药部位清洁干燥。需要注意的是，每个人的病情不同，对药物的反应也不一样。而且，在使用药膏治疗扁平疣时，要遵循医生的指导，不要自行随意用药。同时，扁平疣具有一定的传染性，在治疗过程中要注意避免搔抓，防止自身接种传播。如果扁平疣数量较多或长期不愈，可能需要结合其他治疗方法，如冷冻、激光等。另外，孕妇、哺乳期妇女以及皮肤敏感者在使用相关药膏时要格外谨慎，最好先咨询医生的意见。