紧急避孕药的原理主要是通过影响生殖过程的不同环节来达到避孕目的。一般来说，紧急避孕药需在无保护性生活或避孕失败后72小时内服用。
抑制排卵
原理阐述：紧急避孕药中的某些成分可以抑制垂体分泌促性腺激素，从而抑制卵巢的排卵功能。例如，常见的紧急避孕药左炔诺孕酮等，能够干扰下丘脑-垂体-卵巢轴的正常功能，使得卵巢无法正常排出卵子，这样就避免了精子和卵子相遇结合形成受精卵。特殊情况：不过，不同个体对药物抑制排卵的反应可能存在差异，但总体上这是紧急避孕药发挥作用的一个重要机制。
阻碍受精
改变宫颈黏液性状：紧急避孕药还能改变宫颈黏液的性状。正常情况下，宫颈黏液会随着月经周期发生变化，在排卵期时黏液稀薄，利于精子通过。而服用紧急避孕药后，宫颈黏液会变得黏稠，像厚厚的屏障一样，阻止精子穿过宫颈进入宫腔，从而阻碍了受精过程。影响输卵管蠕动：部分紧急避孕药还可能影响输卵管的正常蠕动。输卵管的蠕动有助于受精卵向子宫方向移动，当输卵管蠕动受到影响时，即使精子和卵子结合形成了受精卵，也难以顺利到达子宫着床，进而达到避孕的效果。
干扰着床
影响子宫内膜：紧急避孕药会干扰子宫内膜的正常发育。子宫内膜需要在合适的状态下才能接受受精卵着床，如果子宫内膜的形态、厚度等不符合受精卵着床的要求，即使受精卵形成并到达子宫，也无法着床。例如，药物可能会使子宫内膜变薄或者出现不规则的变化，使得受精卵难以在子宫内稳定着床。对着床环境的破坏：另外，药物可能会改变子宫内的生化环境，破坏有利于受精卵着床的微环境，使得受精卵无法在子宫内成功着床，从而实现避孕的目的。