做支气管镜检查一般来说风险较低，但也可能存在一些危害。总体而言，其严重危害发生的概率较低，大约在1%以下，但仍需了解相关情况。
出血风险
少量出血：在支气管镜检查过程中，可能会导致支气管黏膜少量出血，通常出血量较少，大多可自行停止，一般不需要特殊处理。大量出血风险：虽然比较罕见，但也有可能出现较大量的出血，这时候可能需要进一步的止血处理，比如通过药物止血或者在支气管镜下进行止血操作等。
气道损伤风险
黏膜擦伤：操作时支气管镜可能会对支气管黏膜造成轻微擦伤，患者可能会有短暂的咽部不适、咳嗽等症状，一般数天内可恢复。气道穿孔：这是较为严重的情况，发生概率极低，但一旦发生，可能需要进行外科手术等处理来修复气道穿孔。
术后感染风险
局部感染：检查后有极小的可能发生局部感染，表现为发热、咳嗽加重等症状。通常可以通过使用抗生素来进行治疗，但需要根据感染的具体情况由医生判断用药。全身感染扩散：这种情况非常罕见，但如果发生，可能会导致较为严重的全身感染症状，需要及时进行抗感染等综合治疗。
其他可能风险
麻醉相关风险：如果需要进行麻醉，可能会有对麻醉药物过敏的风险，虽然发生概率低，但一旦发生过敏反应可能会比较严重，如出现呼吸困难、皮疹等症状，医生会在检查前进行详细的麻醉评估并做好应对过敏的准备。心脑血管意外风险：对于一些本身有基础心脑血管疾病的患者，在检查过程中可能因为紧张等因素诱发心脑血管意外，不过通过术前对患者心脑血管状况的评估以及术中的密切监测，这种风险可以大大降低。