做支气管镜检查一般来说风险较低，但也可能存在一些危害。一般检查过程中可能出现少量出血，不过大多数情况下出血量很少，可能占比在1%以内。
出血风险
轻微痰中带血： 在支气管镜检查时，可能会对支气管黏膜造成轻微损伤，导致少量出血，表现为痰中带血，这种情况较为常见，一般1 - 2天内可自行缓解。严重大咯血： 虽然发生概率较低，约为0.1%左右，但也有可能出现较为严重的大咯血情况，不过通过及时的医疗处理大多能得到控制。
气道反应
咳嗽加重： 检查后部分患者可能会出现咳嗽加重的情况，这是因为支气管镜刺激了气道，一般持续数天可逐渐缓解。有的患者咳嗽可能会持续3 - 5天。支气管痉挛： 少数患者可能会出现支气管痉挛，表现为呼吸困难。不过通过使用支气管扩张剂等药物大多能迅速缓解。
感染风险
肺部感染： 一般来说发生概率较低，约为0.5%以下，但如果患者自身抵抗力较低，或者操作过程中无菌操作不严格，就有可能引发肺部感染，出现发热、咳嗽咳痰加重等症状。
麻醉相关风险
局麻过敏： 如果患者对局部麻醉药物过敏，可能会出现皮疹、瘙痒、呼吸困难等过敏反应。虽然发生概率较低，约为0.05%左右，但需要提前进行过敏测试来排查。全麻风险： 对于需要进行全身麻醉的患者，可能存在全麻相关的风险，比如呼吸抑制、心脑血管意外等，但这些风险的发生概率都非常低，在专业麻醉医生的监护下可以有效降低风险。