肛门直肠周围脓肿主要分为以下几类：
按病变部位分类
肛周皮下脓肿： 最为常见，约占肛门直肠周围脓肿的25% - 30%。多是肛腺感染经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成。一般表现为肛周皮下疼痛，开始为胀痛，化脓时为跳痛，排便时疼痛加重。局部检查可发现肛周有红肿硬结，压痛明显。坐骨直肠窝脓肿： 比较常见，占肛门直肠周围脓肿的20% - 25%。是肛管直肠周围间隙的化脓性感染。患者会有持续胀痛，逐渐加重为明显跳痛，还可能伴有全身感染症状，如发热、乏力等。直肠指诊可触及患侧有饱满感，有压痛和波动感。
按感染病菌分类
非特异性肛门直肠周围脓肿： 多由大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌等常见病菌感染引起。这些病菌通常是从肛腺侵入，导致肛周组织感染化脓。一般通过常规的抗感染治疗有一定效果，但需要根据药敏试验调整用药。特异性肛门直肠周围脓肿： 比如结核性肛门直肠周围脓肿，较为少见。多有结核病史，脓肿发展相对缓慢，脓液稀薄，可能伴有低热、盗汗、乏力等结核中毒症状。治疗除了针对脓肿引流等处理外，还需要进行抗结核治疗。
按脓肿的深浅分类
低位肛门直肠周围脓肿： 病变位置较浅，局限在肛门直肠周围的皮下组织或浅部括约肌周围。临床症状相对局限，主要表现为局部的红肿热痛等炎症表现，手术相对简单，预后较好。高位肛门直肠周围脓肿： 病变位置较深，涉及深部括约肌、肛提肌甚至盆腔间隙等。病情相对复杂，可能伴有全身症状更明显，手术难度较大，术后恢复时间相对较长，复发的风险也相对较高。