怀孕甲状腺蛋白抗体高的处理需依据个人身体状况，具体如下：
一、如果仅甲状腺蛋白抗体高，而游离T3、游离T4、TSH均正常，通常无明显影响。可定期复查，同时多留意自身身体状况，保持心情舒畅即可。这是因为单纯的甲状腺蛋白抗体升高，其他甲状腺功能指标正常时，一般不太会对孕妇及胎儿产生实质性的不良影响。定期复查能及时监测到可能出现的变化，而保持舒畅心情有助于维持身体的良好状态。
二、如果甲状腺蛋白抗体高且伴有TSH升高，不论游离T3、游离T4结果是否降低，可能患有甲减。此时可在医生指导下服用左甲状腺素钠片或甲状腺粉等药物进行治疗。患者要保持良好心情，避免食用辛辣刺激性食物，多喝水，注意休息，不要熬夜，不要抽烟喝酒，并定期复查。因为这种情况下存在甲减的可能，需要通过药物来调节甲状腺功能，使其尽量维持在正常范围内。而良好的生活习惯和心态对于病情的稳定和恢复也非常重要，定期复查则可以及时了解治疗效果和病情变化。
总之，怀孕时出现甲状腺蛋白抗体高要根据具体情况采取相应措施，密切关注并遵医嘱进行处理。