双肾多发性结石的处理需依据具体状况选择保守治疗或手术治疗等方式。
一、保守治疗：如果患者的双肾多发性结石较小、数量少，且未出现肾积水情况，那么可采取保守治疗。这包括大量饮水，增加运动量，同时在医生指导下服用相关药物进行治疗，例如复方金钱草、复方石淋通等，这些药物有助于促进结石排出体外。
二、手术治疗：要是患者的双肾多发性结石较大、数量多，还伴有肾积水状况，此时就建议前往医院进行手术治疗，像输尿管软镜碎石手术、经皮肾镜碎石术等。通常需要分两次进行手术，先做一侧，一周后再做另一侧。
总之，对于双肾多发性结石，要根据结石的具体情况选择合适的治疗方法，以达到较好的治疗效果。