肠子上长息肉的原因有多种。一般来说，遗传因素是其中一个重要原因，比如家族性腺瘤性息肉病，这是一种常染色体显性遗传性疾病，有家族病史的人群患病风险比普通人高很多。另外，炎症刺激也可能引发肠子长息肉，像长期患有结肠炎的患者，肠道长期受到炎症的反复刺激，就容易导致肠黏膜异常增生形成息肉，这种情况在结肠炎患者中并不少见。
遗传因素相关
家族性腺瘤性息肉病： 这是由基因突变引起的遗传性疾病，患者从青少年时期开始，肠道内就会逐渐长出大量腺瘤性息肉，如果不及时治疗，到中年时期几乎都会发生癌变。这种疾病有明显的家族聚集性，如果家族中有亲属患有此类疾病，其他家族成员要提高警惕，定期进行肠镜检查。错构瘤性息肉综合征： 也是一种遗传性疾病，包括黑斑息肉综合征等，患者肠道会出现错构瘤性息肉，同时皮肤和黏膜会有色素沉着，这类疾病同样与遗传基因异常有关。
炎症刺激方面
慢性结肠炎引发： 长期的慢性结肠炎，肠道黏膜反复受到炎症因子的刺激，会导致肠上皮细胞异常增殖。例如，一些慢性结肠炎患者病程可达数年甚至十几年，在这样长期炎症环境下，肠道内就容易长出息肉。而且，炎症的严重程度和持续时间与息肉的发生发展有一定关系，炎症越重、持续时间越长，长息肉的可能性越大。肠道寄生虫感染导致： 肠道内如果有寄生虫长期感染，比如蛔虫、绦虫等，寄生虫在肠道内寄生会刺激肠道黏膜，引起黏膜的炎性反应，长期下来也可能促使息肉形成。有研究发现，肠道寄生虫感染人群中肠息肉的发生率比没有感染的人群要高一些。
生活方式因素
饮食不均衡： 长期高脂肪、低纤维的饮食会增加肠子长息肉的风险。比如经常大量摄入红肉（如牛肉、猪肉）、油炸食品等高脂肪食物，而蔬菜、水果等富含膳食纤维的食物摄入不足。膳食纤维可以促进肠道蠕动，帮助排出肠道内的有害物质，长期缺乏膳食纤维会使肠道内环境发生改变，容易诱发息肉。有调查显示，饮食中膳食纤维摄入低于15克/天的人群，肠息肉的发生率明显高于摄入充足的人群。吸烟酗酒： 吸烟和过量饮酒也是肠子长息肉的诱因。烟草中的尼古丁等有害物质会损伤肠道黏膜，影响肠道的正常功能；过量饮酒会刺激肠道，导致肠道黏膜充血、水肿，长期如此会增加息肉发生的几率。有研究表明，长期吸烟人群患肠息肉的风险比不吸烟人群高约30%，长期大量饮酒者患肠息肉的风险也显著升高。