孕3个月肚子隐隐作痛可能由以下原因导致：子宫增大、胃肠痉挛、宫外孕、先兆流产。
一、子宫增大
孕3个月处于孕早期，此时子宫逐渐增大，增大的子宫会牵拉盆腔韧带，从而出现肚子隐隐作痛的情况。这种通常无需特殊治疗，建议平时多注意休息，避免剧烈运动或重体力劳动。
二、胃肠痉挛
如果长期食用刺激性食物，可能导致胃肠道痉挛，进而引起肚子隐隐作痛。这种情况最好前往当地正规医院进行相关检查，以明确具体原因并对症治疗。
三、宫外孕
孕3个月肚子隐隐作痛与宫外孕有一定关联。一些特殊部位的异位妊娠，比如输卵管间质部的异位妊娠，其子宫胚胎破裂时间通常较晚，可能在妊娠三个月左右出现破裂，因而会有肚子隐隐作痛的表现。此时需要及时到医院就诊，如果确定是宫外孕因素，必要时需终止妊娠。
四、先兆流产
先兆流产的临床症状包括腹部隐隐作痛，同时还伴有阴道出血。这种情况需及时到医院就诊，在医生指导下服用保胎药物进行治疗，如黄体酮等。
总结提示：孕3个月肚子隐痛的原因多样，可能涉及子宫变化、胃肠问题、宫外孕及先兆流产等，应根据具体症状和检查结果来明确原因，并采取相应的治疗措施。