急性胃肠炎通常可以使用止泻药、益生菌、解痉药等来缓解症状，一般及时用药后1-3天左右能逐渐好转。比如常用的蒙脱石散，能在6小时内起到止泻作用。
止泻药物选择
蒙脱石散：它能吸附肠道内的病菌和毒素，保护肠道黏膜，成人每次服用1袋（3克），用50毫升温水冲泡后服用，一般服用后1-2天腹泻症状会有所改善。黄连素片：具有清热燥湿、行气止痛的作用，对肠道细菌感染引起的急性胃肠炎导致的腹泻有一定疗效，成人一般一次服用4片，一天3次。
调节肠道菌群药物
双歧杆菌四联活菌片：可以补充肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，改善因肠道菌群失调引起的急性胃肠炎症状，儿童和成人都可服用，儿童一次1片，一天3次；成人一次3片，一天3次。地衣芽孢杆菌活菌胶囊：能促进肠道有益菌生长，抑制有害菌繁殖，适用于细菌或真菌引起的急、慢性肠炎，成人一次2粒，一天3次。
解痉止痛药物
颠茄片：能解除胃肠道平滑肌痉挛，缓解急性胃肠炎引起的腹痛，成人一次服用1-2片，一天3次。但青光眼患者禁用，前列腺增生患者慎用。山莨菪碱片：也可缓解胃肠道痉挛性疼痛，成人一次5-10毫克，一天3次，不良反应有口干、面红、视物模糊等，反流性食管炎、重症溃疡性结肠炎患者慎用。
抗感染药物使用
如果是细菌感染引起的急性胃肠炎，可根据病情选用抗生素，如诺氟沙星胶囊，适用于敏感菌所致的肠道感染，但18岁以下青少年、儿童禁止使用，因为可能会影响骨骼发育。如果是病毒感染引起的，一般不需要使用抗感染药物，以对症治疗为主。