一、可能的原因
（一）外伤因素
1.外力撞击：男性在日常活动中，如运动时不慎碰撞到阴茎根部两侧，或者受到外力直接击打，可能导致局部软组织损伤甚至骨骼（耻骨等）损伤，从而引起疼痛。这种情况在年轻爱运动的男性中较为常见，比如进行足球、篮球等对抗性运动时，若防护不当就容易发生。
2.性生活损伤：性生活过程中过于剧烈、粗暴，也可能造成阴茎根部两侧的组织损伤，引发疼痛。不同年龄和性经验的人群都可能出现，年轻性活跃人群相对更易因性生活方式不当而发生。
（二）感染因素
1.尿道炎蔓延：尿道发生细菌、支原体、衣原体等感染时，炎症可能蔓延至阴茎根部两侧的组织。例如非淋菌性尿道炎，病原体感染尿道后，可通过淋巴等途径波及周围组织，引起阴茎根部两侧疼痛。各年龄段都可能发生，性生活活跃的中青年发病率相对较高。
2.附睾炎牵连：附睾发生炎症时，炎症可能扩散影响到阴茎根部两侧。附睾炎常见于中青年男性，多由细菌感染引起，如大肠杆菌等，炎症蔓延可导致阴茎根部两侧疼痛。
3.前列腺炎放射痛：前列腺炎患者，炎症刺激可能通过神经反射引起阴茎根部两侧牵涉痛。前列腺炎在成年男性中较为常见，尤其是中年男性发病率逐渐上升。
（三）泌尿系统结石
1.尿道结石或耻骨联合附近结石：尿道内结石或者耻骨联合附近的结石，可刺激周围组织引起疼痛，疼痛可能放射至阴茎根部两侧。各年龄段都有发病可能，结石形成与个人代谢、饮食等多种因素相关，比如长期饮水少、饮食中高钙等人群易患。
（四）神经因素
1.神经性疼痛：如坐骨神经痛等，疼痛可能放射到阴茎根部两侧。不同年龄人群都可能因神经病变等原因导致，比如腰椎间盘突出压迫神经可能引起放射性疼痛至阴茎根部两侧，中老年人相对更易出现腰椎间盘突出相关问题。
二、就医检查
（一）体格检查
医生会详细检查阴茎根部两侧的外观，有无红肿、淤血、损伤等情况，同时会检查睾丸、附睾、前列腺等相关部位，初步判断可能的病因。不同年龄和性别的人群检查重点类似，但对于儿童会更注重轻柔操作，避免造成不必要的伤害。
（二）实验室检查
1.血常规：通过血常规检查白细胞、中性粒细胞等指标，判断是否存在感染情况。各年龄段人群都可进行该项检查，感染时通常会出现白细胞计数升高、中性粒细胞比例升高等表现。
2.尿常规：检查尿液中是否有白细胞、细菌等，有助于判断泌尿系统感染情况。不同年龄和性别的人群都需要进行尿常规检查，若有泌尿系统感染，尿液中可出现相应异常成分。
3.前列腺液检查：对于怀疑前列腺炎的患者，进行前列腺液检查。成年男性较为常见该项检查，通过前列腺液的常规检查等可以辅助诊断前列腺炎。
（三）影像学检查
1.超声检查：可以检查阴茎根部两侧的组织结构，如是否有组织损伤、结石等情况。各年龄段人群均可进行超声检查，儿童进行超声检查时要注意选择合适的超声频率和检查方式，避免辐射过量等问题。
2.X线检查：对于怀疑有骨骼损伤或结石等情况时可进行X线检查，了解骨骼结构及是否有结石等。不同年龄人群根据病情需要进行，儿童进行X线检查要严格控制辐射剂量。
三、应对措施（非药物干预为主）
（一）休息与制动
如果是外伤等因素引起的疼痛，首先要让患者休息，避免剧烈活动，减少阴茎根部两侧的刺激。对于儿童要安抚其情绪，使其保持安静，减少不必要的活动；对于成年人要强调休息的重要性，避免加重损伤。
（二）局部冷敷或热敷
1.冷敷：如果是外伤后短期内（一般24-48小时内），可进行局部冷敷，每次15-20分钟，每天3-4次，以减轻肿胀和疼痛。儿童冷敷时要注意控制冷敷时间和温度，避免冻伤；成年人冷敷相对可稍长些时间，但也需注意。
2.热敷：外伤48小时后，可进行局部热敷，促进血液循环，利于消肿止痛。不同年龄人群热敷时温度要适宜，儿童热敷温度不宜过高，避免烫伤。
（三）及时就医明确诊断
无论何种年龄和性别，一旦出现阴茎根部两侧疼痛，都应及时就医，进行详细检查以明确病因，避免延误病情。比如儿童出现该症状更要重视，因为儿童表述可能不准确，需通过专业检查明确病因后进行针对性处理。
总之，阴茎根部两侧疼可能由多种原因引起，需要根据具体情况进行详细检查以明确病因，并采取相应的非药物或药物等治疗措施，不同年龄和性别的人群在检查和治疗过程中需注意各自的特点和禁忌。