真菌性阴炎主要是由白色念珠菌等真菌感染引起的，约75%的女性一生中至少患过1次真菌性阴炎。
阴道内环境改变诱发
阴道pH值变化：正常阴道内环境呈弱酸性，pH值一般在3.8~4.4之间，这种环境有利于乳酸杆菌生长，抑制其他病菌繁殖。当身体状况改变时，比如长期使用抗生素，会抑制乳酸杆菌生长，使阴道pH值升高，从而为白色念珠菌等真菌创造有利生长环境。糖原含量变化：女性怀孕后，体内雌激素水平升高，会使阴道上皮细胞内糖原含量增加，阴道酸度提高，也容易引发真菌性阴炎。另外，糖尿病患者血糖控制不佳时，阴道内糖原含量同样会增多，真菌容易滋生。
外界因素传播感染
公共卫生场所接触：在公共浴池、游泳池、宾馆等公共场所，如果接触到被真菌污染的物品，像毛巾、浴盆、马桶座圈等，就有可能感染真菌性阴炎。比如公共浴池的水温、湿度适合真菌存活，接触被污染的物品后，真菌就可能附着在女性外阴或阴道处引发感染。性接触传播：虽然真菌性阴炎不是严格意义上的性传播疾病，但男性携带真菌时，通过性接触有可能将真菌传染给女性。男性感染真菌后可能没有明显症状，但会成为传染源传播给女性伴侣。
自身免疫力下降引发
长期使用免疫抑制剂：一些患有自身免疫性疾病的患者，需要长期使用免疫抑制剂进行治疗，比如系统性红斑狼疮患者长期使用糖皮质激素等免疫抑制剂，会使身体免疫力下降，容易受到真菌侵袭，引发真菌性阴炎。患有基础疾病：像艾滋病患者，由于免疫系统严重受损，抵抗力极低，很容易感染各种真菌，包括引发真菌性阴炎。另外，患有严重糖尿病且血糖控制很差的患者，也因为自身免疫力相对低下，容易发生真菌性阴炎。