月经结束的第三天同房相对来说怀孕风险较低，但也不是绝对安全的。一般女性的月经周期若为28-30天，排卵期通常在下次月经前14天左右，月经结束第三天处于相对安全期，但也有少数女性月经周期不规律，仍可能排卵，存在一定怀孕几率。
受孕可能性方面
月经周期规律者： 对于月经周期比较规律，比如28-30天一个周期的女性，月经持续时间平均3-7天，那么月经结束第三天距离下次排卵时间相对较远，受孕概率相对较低，大概在5% - 10%左右。但这也不是绝对不会怀孕，因为个体差异存在，有的女性可能会有额外排卵情况。月经周期不规律者： 如果女性月经周期不规律，提前或者推后，那么就很难准确判断排卵期，月经结束第三天有可能已经接近排卵期，受孕概率会相应增加，甚至能达到20%左右。
健康风险方面
感染风险： 同房时若不注意卫生，还是有可能增加感染妇科炎症的风险。因为即使月经刚结束，阴道内环境还没有完全恢复到正常的防御状态，细菌等病原体容易侵入。比如可能引发阴道炎，出现阴道分泌物增多、异味、瘙痒等症状；或者引起宫颈炎，导致白带异常、性交后出血等情况。子宫收缩影响： 同房过程中子宫会有收缩，对于月经刚结束的女性，子宫创面还没有完全修复好的话，子宫收缩可能会导致少量阴道出血再次出现，一般量不多，短时间内会自行停止，但如果频繁出现这种情况或者出血量较多，就需要引起重视。
卫生注意事项
清洁方面： 同房前后双方都要注意清洗外生殖器，男性要清洗阴茎包皮内的污垢，女性要清洗外阴部，保持局部清洁卫生，降低感染几率。使用防护措施： 如果没有怀孕计划，即使是在所谓的安全期，也建议使用安全套等避孕措施，这样可以更好地避免意外怀孕以及减少性传播疾病的发生风险。