正常情况下适量饮用水果酵素几乎没有副作用和危害，但少量体质敏感人群饮用后可能出现过敏反应，如腹痛、出汗等，过量饮用也可能带来一些不良影响。
一、过敏反应。少量体质敏感人群饮用后可能会有腹痛、出汗、腹痛等过敏症状。
二、对肠胃的影响。果蔬酵素中含有大量果酸，过量饮用可能损伤胃黏膜，增加胃炎等疾病风险；而且果蔬酵素通常采用自然发酵方式，自制过程中可能产生大量病菌，导致人体食物中毒，出现上吐下泻、头晕等不良反应。
三、营养不良问题。经常吃果蔬酵素可能造成机体营养不良，无法保证足够营养供应，易引起全身疲劳，以及不健康的减肥或导致疾病；同时不能保证充分的营养供给，容易让人产生全身乏力。
四、对肠胃蠕动的影响。果蔬酵素中含有较多膳食纤维，可促进胃肠道蠕动，但长期饮用可能导致依赖性，易使肠胃蠕动变慢，代谢废物无法及时排出，产生便秘问题。
总之，饮用水果酵素要注意适量，对于体质敏感人群要格外谨慎，并且要关注其可能带来的各种不良影响，避免对身体造成不必要的损害。