小孩嘴唇上起水泡常见原因之一是单纯疱疹病毒感染，这是由单纯疱疹病毒Ⅰ型引起的，儿童感染率较高，尤其是6个月 - 5岁的孩子更容易被感染。
病毒感染因素
单纯疱疹病毒初次感染： 当小孩首次接触单纯疱疹病毒时，就可能引发嘴唇起水泡。比如在幼儿园等集体环境中，容易相互传染。病毒会在体内潜伏，当孩子抵抗力下降时，比如感冒、发热、过度疲劳等情况，病毒就会活跃起来，导致嘴唇出现成簇的小水泡。复发感染： 即使初次感染好了，病毒还可能潜伏在体内神经节中，日后在一些诱因下复发，也会让小孩嘴唇起水泡。
缺乏维生素
维生素B族缺乏： 如果小孩饮食不均衡，比如挑食、偏食，就容易缺乏维生素B族。其中维生素B2缺乏时，可能会出现嘴唇干裂、起水泡等症状。一般来说，正常儿童每天需要摄入一定量的维生素B2，像年龄较小的幼儿每天大概需要1.2 - 1.5毫克，儿童期大概需要1.6 - 2.2毫克等。如果摄入不足就容易引发嘴唇起水泡等问题。维生素C缺乏： 维生素C对维持皮肤黏膜的健康很重要，缺乏维生素C时，小孩身体的抵抗力会下降，也可能出现嘴唇起水泡的情况。正常儿童每天需要摄入适量的维生素C，比如4 - 6岁儿童每天需要40 - 60毫克等，不足时就可能出现相关症状。
外伤或摩擦
咬伤或摩擦： 小孩如果不小心咬伤自己的嘴唇，或者嘴唇受到摩擦，比如吃东西时嘴唇被牙齿或食物摩擦到，就可能导致局部起水泡。比如小孩在啃咬玩具、大口吃东西速度过快时，都可能造成嘴唇的外伤，进而引发水泡。刺激性食物刺激： 小孩吃了过烫、过于辛辣刺激的食物，也可能刺激嘴唇，引起局部起水泡。例如吃了很烫的火锅、辣椒等，会对嘴唇的黏膜造成刺激，导致黏膜损伤起水泡。