睡醒嗓子疼有痰可能是多种原因导致的。比如夜间睡眠时空气干燥，会使咽喉部黏膜水分丢失，导致嗓子疼有痰，这种情况在秋冬季节较为常见，尤其在室内有暖气或空调时更容易发生。
常见原因一：上呼吸道感染
病毒感染引起： 像普通感冒病毒感染后，会引发咽喉部炎症，导致嗓子疼痛，同时炎症刺激呼吸道黏膜分泌增多，产生痰液。一般病毒感染具有自限性，病程通常在7 - 10天左右，但在此期间可能会持续有嗓子疼有痰的症状。细菌感染引起： 若上呼吸道感染合并细菌感染，比如链球菌感染，会使嗓子疼痛更加明显，痰液可能会变为黄色脓性痰。
常见原因二：环境因素
空气干燥： 当室内空气湿度低于40%时，就容易导致咽喉部黏膜干燥，夜间睡眠时这种情况可能会加重，从而出现嗓子疼有痰的感觉。尤其是在使用电暖器、空调等设备时，空气湿度降低更为明显。空气污染： 如果居住环境或室内有较多的粉尘、烟雾、有害气体等，会刺激咽喉部和呼吸道，导致嗓子疼有痰，比如长期处于雾霾天气中，或者室内有吸烟等情况。
常见原因三：咽喉部本身疾病
慢性咽炎： 患有慢性咽炎的人，咽喉部黏膜长期处于慢性炎症状态，睡醒后容易出现嗓子疼有痰的情况，痰液一般为白色黏液痰。病情容易反复发作，病程较长，可能会持续数月甚至数年。扁桃体炎： 扁桃体发炎时，炎症会累及咽喉部，导致嗓子疼痛，同时扁桃体部位的炎症刺激也会使分泌物增多，产生痰液。急性扁桃体炎起病较急，可能伴有发热等症状；慢性扁桃体炎则反复发作，容易出现睡醒后嗓子疼有痰的情况。