孕后期臀部两侧骨头痛，主要与以下原因相关：
一、胎儿或羊水负荷过重：在孕后期，胎儿不断发育长大以及羊水增多，会导致后侧骶髂关节承受的负荷过重，从而引发骶髂关节周围出现炎症，进而导致此处疼痛。
二、骨质疏松：因为胎儿的生长会大量消耗母体内的钙质，如果孕妇在此时营养跟不上，就很容易出现骨质疏松的情况，之后就可能在腰椎、骨盆以及下肢等部位产生骨性疼痛。
三、肌肉疲劳：孕妇在孕期长期挺起腹部，会使臀部以及腰骶部位的肌肉出现疲劳，进而产生酸痛感，有时会让孕妇误以为是骨性疼痛。
四、周围神经病变：在妊娠后期可能会出现腰椎间盘突出或者坐骨神经痛等周围神经病变，从而引起此处放射性疼痛，让孕妇误以为是骨性疼痛。
总结概况提示：孕后期臀部两侧骨头痛可能由多种原因引起，包括胎儿及羊水负荷、骨质疏松、肌肉疲劳和周围神经病变等，需要注意区分具体情况。