胚胎染色体异常的原因较多，其中孕妇年龄是一个重要因素，女性年龄越大，卵子发生染色体不分离的概率越高，比如35岁以上孕妇染色体异常胎儿的发生率明显升高。另外，父亲的年龄也有影响，男性年龄过大时，精子的染色体也容易发生异常。
一、母体因素影响
内分泌失调： 母体自身的内分泌环境对胚胎发育至关重要，若母体存在甲状腺功能异常等内分泌疾病，会干扰胚胎的正常发育，增加染色体异常风险。比如甲状腺功能减退时，体内激素水平失衡，影响胚胎染色体的稳定。不良生活习惯： 长期吸烟、酗酒的女性，其卵子和精子质量易受影响，从而增加胚胎染色体异常的几率。有研究表明，吸烟女性孕育染色体异常胚胎的可能性比不吸烟女性高出一定比例。
二、外界环境因素
辐射暴露： 孕妇接触过高剂量的辐射，如长期处于辐射环境工作或接受过放射性检查等，会损伤生殖细胞的染色体结构，导致胚胎染色体异常。例如在核辐射环境工作的女性，胚胎发生染色体异常的风险显著增加。化学物质接触： 长期接触某些化学物质，像农药、甲醛等，这些物质可能会破坏染色体的完整性，引发胚胎染色体异常。比如长期接触含苯农药的人群，其生育染色体异常胚胎的可能性升高。
三、遗传因素相关
家族遗传病史： 如果家族中有染色体异常相关的遗传疾病，如平衡易位等染色体结构异常的情况，那么后代发生胚胎染色体异常的概率会增加。家族中若有人携带平衡易位染色体，其生育的胚胎出现染色体异常的风险较普通人群高很多。父母染色体异常： 若父母一方或双方存在染色体结构或数目异常，那么遗传给胚胎的概率较大，导致胚胎染色体异常。比如父母一方是染色体平衡易位携带者，其孕育的胚胎发生染色体异常的可能性就比较高。