胚胎染色体异常是导致流产、胎儿畸形等问题的重要原因之一，据统计，在早期自然流产中，约50%~60%与胚胎染色体异常有关。
年龄因素：
女性年龄：女性年龄越大，胚胎染色体异常的发生率越高。一般来说，女性35岁以后，卵子质量下降，染色体发生异常的概率明显增加。比如35岁以上孕妇发生21-三体综合征（唐氏综合征）的风险约为1/350，而40岁以上则升高到1/100左右。男性年龄：男性年龄增大也会影响精子质量，增加胚胎染色体异常的可能性。研究发现，40岁以上男性的精子染色体异常率会有所上升。
环境因素：
辐射暴露：长期接触高剂量的辐射，如职业性接触放射性物质、接受过量的医疗辐射检查等，会损伤生殖细胞的染色体，从而导致胚胎染色体异常。例如，在核电站工作且未做好防护措施的人员，其后代胚胎染色体异常风险会增加。化学物质接触：长期接触某些化学物质，像苯、甲醛、农药等。例如，从事化工行业且工作环境中化学物质防护不佳的人群，其生殖细胞可能受到化学物质影响，使胚胎染色体发生畸变。
遗传因素：
夫妻一方染色体异常：如果夫妻双方有一方存在染色体结构或数目异常，就有可能遗传给胚胎。比如平衡易位携带者，虽然自身表型正常，但在形成生殖细胞时，会产生异常的配子，导致胚胎染色体异常的概率大大增加。家族遗传病史：某些家族遗传性疾病可能与染色体异常相关，如果家族中有染色体异常相关疾病的病史，那么后代发生胚胎染色体异常的风险也会相对较高。例如家族中有遗传性的脆性X综合征等，其后代胚胎染色体出现异常的可能性增加。
生活方式因素：
不良生活习惯：长期吸烟、酗酒的夫妻，其生殖细胞受到损害，容易出现染色体异常。烟草中的尼古丁等有害物质以及酒精都会影响精子和卵子的质量，增加胚胎染色体异常的几率。比如每天吸烟超过10支的男性，其精子畸形率会明显升高，进而影响胚胎染色体情况；女性长期酗酒，也会干扰卵子的正常发育，导致胚胎染色体异常风险上升。营养缺乏：孕期或孕前夫妻双方营养不均衡，缺乏某些重要的营养素，如叶酸等，也可能影响胚胎染色体的正常形成。叶酸缺乏会干扰DNA的合成和修复，增加染色体异常的发生风险。