甲状腺炎的引发原因较多，比如自身免疫因素就可能导致，像自身免疫性甲状腺炎，约有10% - 15%的人群可能存在自身免疫相关的遗传易感性，使得免疫系统错误攻击甲状腺组织从而引发炎症。
自身免疫因素导致的甲状腺炎
桥本甲状腺炎：这是最常见的自身免疫性甲状腺炎类型，是由于机体免疫系统紊乱，产生攻击甲状腺的自身抗体，如甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）、甲状腺球蛋白抗体（TgAb）等，持续攻击甲状腺细胞，逐渐引起甲状腺炎症，病程可能较长，有的患者数年才会出现明显症状。Graves病相关甲状腺炎：Graves病患者体内存在促甲状腺激素受体抗体（TRAb），这种抗体刺激甲状腺细胞过度增生和分泌甲状腺激素，同时也会引发甲状腺的炎症反应，患者常伴有甲状腺肿大、手抖、心慌等症状。
感染因素引发的甲状腺炎
病毒感染：比如病毒性甲状腺炎，像柯萨奇病毒、腮腺炎病毒、流感病毒等感染后，可能会引发甲状腺的炎症反应。有研究发现，约10% - 20%的亚急性甲状腺炎是由病毒感染引起的，患者通常在发病前1 - 3周有上呼吸道感染病史，随后出现甲状腺部位疼痛、发热等症状。细菌感染：虽然相对少见，但某些细菌感染也可能导致甲状腺炎，如金黄色葡萄球菌等细菌感染甲状腺组织，引发局部的炎症反应，不过这种情况在临床上相对不多见。
辐射因素导致的甲状腺炎
放射性损伤：如果头颈部接受过放射性治疗，比如因其他疾病接受过颈部放疗，或者长期处于放射性污染环境中，射线可能会损伤甲状腺组织，导致甲状腺炎的发生。有数据显示，头颈部接受过放射治疗的人群，发生甲状腺炎的风险比正常人高出数倍，而且放射治疗后甲状腺炎的发生时间可能在数年之后。医源性辐射：在一些医疗检查中，如颈部CT等，虽然辐射剂量较低，但长期或多次接触也可能对甲状腺有一定影响，不过一般这种情况引发甲状腺炎的几率相对较低，但也是需要关注的一个因素。