三岁孩子反复发烧39.5℃，可采取物理降温、药物降温以及多喝水等措施。
一、物理降温：这是较为常用的方法。首先要松解孩子的衣物，避免穿着过厚影响散热；其次可在孩子额头贴上退热贴，退热贴能起到一定的降温作用；再者可以使用温毛巾对孩子腋窝、脖子等相对不容易散热的部位进行擦拭，通过这种方式能加快热量散发。
二、药物降温：39.5℃属于高热范畴，必须高度重视，以预防高热惊厥等不良情况的发生。在实施物理降温的同时，还应进行药物降温，比如通常可以使用布洛芬混悬液等退烧药物来缓解高热症状。
三、多喝水：孩子发烧时，机体排汗量会增多，从而导致机体比较缺水。为防止脱水等问题，应积极给孩子补水。多喝水还能加快体内新陈代谢，有利于有毒物质的排出，对病情恢复有帮助。
此外，孩子反复发烧可能是由于病因不明确或存在隐藏病因，导致治疗不彻底。这种情况下建议进行全身检查，全面了解病因，以便进行针对性的治疗。
总之，对于三岁孩子反复发烧39.5℃的情况，要综合运用多种方法来处理，同时关注是否存在其他病因，确保孩子的健康。