眼睛被树枝戳到后出现眼睛疼，这可能是外伤引发的疼痛，也可能是继发了角膜炎、结膜炎等疾病导致的疼痛，对此建议患者尽快就医，明确病因后予以对症治疗。
一、外伤：若眼睛被树枝戳到后，疼痛并不严重且视力无明显变化，或许只是角膜上皮被划伤，通常可遵循医嘱使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等药物来预防感染。
二、角膜炎：眼睛被树枝戳到致使病原微生物感染，进而引发角膜炎，从而出现眼睛疼的情况，一般还会伴有畏光、流泪、视物模糊等症状，需要按照医嘱运用氟康唑滴眼液、普拉洛芬滴眼液、小牛血去蛋白提取物眼用凝胶等药物进行治疗。
三、结膜炎：可能由于眼睛被树枝戳到后，导致细菌等病原体感染，引起结膜炎，受炎症刺激，也会出现眼睛被树枝戳到而疼痛的现象，通常会有眼部异物感、烧灼感、分泌物增多等表现，患者可遵医嘱通过左氧氟沙星滴眼液、普拉洛芬滴眼液等药物进行治疗。
以上药物均需在医生指导下使用，切不可盲目用药，以免导致病情加重。治疗期间要注意个人卫生，饮食保持清淡，避免食用如辣椒等辛辣食物，维持良好的身体状态，有助于疾病的恢复。
总结概况提示：眼睛被树枝戳到后疼痛，原因多样，可根据不同情况进行针对性治疗，用药需谨慎且要遵循医嘱，同时注意个人和饮食方面的相关事项以促进恢复。