晚上三点左右就醒了可能由多种原因引起，比如睡眠节律紊乱，一般来说，正常人的睡眠周期是有规律的，如果经常熬夜、倒班等，就容易打乱睡眠节律，导致夜间早醒，这种情况比较常见。
睡眠环境因素
环境噪音干扰： 如果睡眠环境中存在持续的噪音，比如附近有建筑工地施工、交通要道车辆嘈杂等，超过40分贝的噪音就可能影响睡眠，使人容易在凌晨三点左右醒来。睡眠环境温度不适： 睡眠时室内温度过高或过低也会影响睡眠，一般睡眠环境温度保持在18~25℃比较适宜，温度过高或过低都可能导致睡眠中断，出现早醒情况。
心理因素影响
压力过大： 现代人生活压力大，比如工作上有未完成的任务、经济上有压力等，长期处于高压力状态下，容易导致焦虑、抑郁等情绪问题，进而影响睡眠，出现凌晨早醒的情况。据相关调查，约有30%~40%的焦虑、抑郁患者存在睡眠早醒的症状。情绪波动： 突然遭遇重大生活事件，如亲人离世、感情挫折等，会引起情绪的剧烈波动，从而干扰睡眠，使人在凌晨三点左右醒来。
疾病相关因素
睡眠呼吸暂停综合征： 这类患者会出现睡眠中呼吸暂停的情况，导致机体缺氧，使人从睡眠中觉醒，从而出现早醒现象，这种疾病在中年肥胖人群中相对常见。内分泌疾病： 例如甲状腺功能亢进，患者甲状腺激素分泌过多，会导致代谢亢进，交感神经兴奋，出现失眠、早醒等睡眠问题。另外，糖尿病患者如果夜间发生低血糖，也可能会导致早醒，有糖尿病的人夜间低血糖时可能还会伴有多汗、心慌等表现。