生化流产是指精卵结合后，没有成功在子宫着床的妊娠。导致生化流产的原因有多种，其中胚胎染色体异常是常见因素，据统计，约50% - 60%的生化流产是因为胚胎染色体本身有问题，比如数目异常或结构异常。
胚胎自身因素：
染色体数目异常： 最常见的是三体，如21 - 三体、18 - 三体等。正常人体细胞染色体是23对，若胚胎染色体数目不对，就难以正常着床发育，从而引发生化流产。染色体结构异常： 像染色体缺失、易位等情况，也会影响胚胎的正常发育，增加生化流产的发生几率。
母体因素：
内分泌失调： 例如黄体功能不全，女性黄体分泌的孕酮不足，就无法为胚胎着床和发育提供良好的子宫内环境。一般来说，黄体期孕酮水平低于正常范围，就可能导致生化流产。甲状腺功能异常也是一个因素，甲状腺功能亢进或减退都会影响激素平衡，进而影响妊娠。子宫因素： 子宫畸形会影响胚胎着床，比如纵隔子宫，子宫腔内有纵隔分隔，会改变子宫内的正常形态和环境，不利于胚胎着床生长。子宫内膜问题也很关键，子宫内膜薄或者有宫腔粘连，都可能使胚胎难以着床，引发生化流产。
免疫因素：
自身免疫异常： 母体存在自身抗体，如抗磷脂抗体综合征，体内的抗磷脂抗体可引起血管内皮损伤，影响胎盘血液循环，阻碍胚胎发育，导致生化流产。同种免疫异常： 母体对胚胎的免疫耐受不足，免疫系统攻击胚胎，使得胚胎无法正常着床和发育，从而出现生化流产。
环境因素：
化学物质接触： 女性接触过多的有害化学物质，像某些农药、重金属等，可能会影响胚胎的正常发育，增加生化流产的风险。比如长期接触含有苯的有机溶剂，就可能对生殖系统产生不良影响。辐射暴露： 受到过高剂量的辐射，如放射性物质接触、长时间处于辐射环境中等，会损害胚胎细胞的遗传物质，导致生化流产。