怀孕40天一般可进行药流。
一、药流的时间条件：怀孕49天之内可以做药流，当怀孕40天时，需先进行B超检查以明确宫内孕。之后还应检查孕囊大小，若孕囊未超过2厘米，则可通过口服药物来实现药物流产。
二、特殊情况分析：有些女性近期做过人流，若连续怀孕后再选择流产，伤害会较大；或者有过剖腹产病史，此次怀孕孕囊位置距离刀口部位较近，这种情况下流产不全的可能性较大，应尽可能避免药流，以免对身体造成更大伤害且难以恢复。总之，是否适合药流，不仅与怀孕时间有关，还和宫内孕囊的具体情况相关，需综合各方面情况来确定，不能仅依据单一指标。
综上所述，怀孕40天能否药流要根据具体情况判断，要综合考虑多种因素。