血管瘤的成因目前尚未完全明确，不过有一些相关因素被认为可能与之有关。目前研究发现，血管形成因子与抑制因子失衡可能是引发血管瘤的一个重要方面，比如血管内皮生长因子等形成因子增多，而抑制因子相对不足时，就容易促使血管异常增生形成血管瘤。
遗传因素方面
部分血管瘤的发生可能与遗传有关。有研究显示，某些遗传基因突变可能会增加患血管瘤的风险。比如有家族史的人群，其后代患血管瘤的几率相对普通人群可能会有所升高，但具体的遗传方式还在进一步研究中，不过大约有5% - 10%的血管瘤患儿有家族遗传倾向相关的因素影响。
胚胎发育过程异常
在胚胎发育的早期阶段，如果血管发育出现异常也可能导致血管瘤。在胚胎时期，血管组织的分化过程中，若出现原始血管网异常增殖等情况，就可能使得局部血管结构异常，进而形成血管瘤。例如在胚胎发育的第3 - 8周时，血管系统的发育如果受到干扰，就可能为血管瘤的形成埋下隐患。
雌激素相关因素
女性血管瘤患者相对较多，这可能与雌激素有关。研究发现，雌激素可能会刺激血管内皮细胞的增殖，从而促进血管瘤的形成。比如在青春期、妊娠期等雌激素水平变化较大的时期，血管瘤的发生率可能会有所变化。女性在妊娠期时，体内雌激素水平大幅升高，部分孕妇可能会发现原有血管瘤增大，这也从一定程度上提示了雌激素与血管瘤的关联。