月经刚干净三天同房后有一点出血，可能由多种原因引起。一般来说，这种情况可能涉及以下几个方面的情况。
原因一：宫腔内残留血液未排净
月经刚结束三天，宫腔内可能还会有少量残留的血液，在同房的刺激下，子宫收缩，就可能导致这少量残留血液排出，从而出现少量出血情况。这种情况通常出血量较少，且没有其他不适症状，一般不需要特殊处理，注意保持外阴清洁即可。
原因二：宫颈因素引起
宫颈炎症：如果本身有宫颈炎症，宫颈组织比较脆弱，同房时的机械刺激容易导致宫颈表面的毛细血管破裂出血。宫颈炎症可能会伴有白带增多、白带发黄等表现。宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈组织的良性增生，息肉表面的血管丰富，同房时容易受到碰撞而出血。这种出血一般颜色鲜红，量较少。
原因三：阴道因素引起
阴道黏膜损伤：同房时如果动作过于粗暴，可能会导致阴道黏膜损伤而引起出血。比如在阴道比较干涩的情况下同房，就容易造成阴道黏膜的擦伤出血。这种情况通常会有明确的同房粗暴史，出血可能会伴有局部疼痛。阴道炎：患有阴道炎时，阴道黏膜处于充血状态，同房刺激后也容易出血。阴道炎还可能伴有阴道瘙痒、白带异味等症状。当然，还有其他一些较少见的原因，比如子宫内膜异位症等，但相对来说比较少见。如果这种同房后出血的情况偶尔发生一次，可以先观察看看；如果经常出现同房后出血，或者伴有其他不适症状，如腹痛、白带异常等，建议及时就医，进行妇科检查、宫颈TCT和HPV检测、B超等相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。