月经干净后两天同房后有点出血，可能是以下原因引起：
1.子宫内膜尚未完全修复：月经刚结束时，子宫内膜可能尚未完全修复，此时同房可能导致少量出血。
2.妇科疾病：如宫颈炎、宫颈息肉、子宫肌瘤等，也可能导致同房后出血。
3.内分泌失调：某些情况下，内分泌失调可能导致月经间期出血。
4.其他因素：如性交过于激烈、使用避孕药等。
如果出血量较少，且没有其他不适症状，可以先观察。同时，需要注意个人卫生，保持外阴清洁。如果出血量较多、持续时间较长或伴有其他不适症状，如腹痛、白带异常等，应及时就医。医生一般会进行详细的妇科检查、超声等检查，以明确出血原因，并给予相应的治疗。
此外，需要提醒的是，对于有性生活的女性，定期进行妇科检查非常重要，可以及时发现和治疗潜在的妇科疾病。同时，应注意性生活卫生，避免不洁性行为。如果对月经干净后同房出血有疑虑，最好咨询医生以获得更专业的建议。