三个月宝宝上火的降火方式包括更换奶粉种类、多喝水、物理疗法以及药物等，且不同脏腑上火的治疗药物有所不同。具体如下：
一、更换奶粉种类：部分宝宝对特定奶粉的成分或配方比例不适应而上火。这时家长要为宝宝更换其他奶粉，同时注意喂养方式，尽量采用少量多餐的喂养模式。
二、多喝水：三个月宝宝上火常与喂养不当、室温较高或包裹过严等有关。多喝水能促进新陈代谢，有助于降火。
三、物理疗法：例如可顺时针按摩腹部、推拿手指和手掌等部位，对积食化热导致的上火有缓解作用。但需注意，三个月宝宝身体娇弱，推拿、按摩时动作要轻柔，还要做好防寒保暖，以防加重宝宝不适。
1.按摩腹部：以顺时针方向轻轻按摩宝宝腹部。
2.推拿手指和手掌：轻柔地进行相关推拿。
四、药物：
1.若上火症状以心火旺盛为主，宝宝可能出现夜间哭闹不安、睡眠不踏实、舌尖红、小便颜色发黄等情况，此时家长可给宝宝应用淡竹叶或莲子心等药物来降火。
(1)淡竹叶：具有清热泻火等功效。
(2)莲子心：能清心安神等。
2.如果上火症状以肝火旺盛为主，可能导致宝宝哭闹不安、性情急躁、眼屎较多等，建议应用栀子或龙胆草水清泻肝火。
(1)栀子：有泻火除烦等作用。
(2)龙胆草：可清热泻肝等。
此外，如果宝宝以吮吸母乳为主，宝妈要保持饮食清淡，尽量避免辣椒、大蒜等辛辣刺激食物，以免加重宝宝上火症状。总之，要根据宝宝的具体情况选择合适的降火方法和措施。