最里面牙齿旁边的肉肿痛，可能是由以下原因引起：
1.智齿冠周炎：智齿是口腔中最后长出的牙齿，由于位置不够，智齿可能无法完全萌出，导致周围的牙龈组织发炎、肿胀。此外，智齿冠周炎还可能导致口臭、吞咽困难等症状。
2.牙龈炎：牙龈炎是指牙龈组织的炎症，通常由细菌感染引起。刷牙不彻底、牙结石堆积等因素都可能导致牙龈炎。
3.牙周炎：牙周炎是一种侵犯牙龈和牙周组织的慢性炎症，多由牙龈炎发展而来，逐渐加重。
4.食物嵌塞：如果牙缝较大或牙齿排列不齐，食物可能容易嵌塞在牙缝中，刺激牙龈，导致肿痛。
5.口腔溃疡：口腔溃疡是一种常见的口腔黏膜疾病，通常表现为口腔黏膜的溃疡性损伤，可能伴有疼痛。
6.其他：口腔肿瘤、外伤等也可能导致最里面牙齿旁边的肉肿痛。
如果出现最里面牙齿旁边的肉肿痛，建议及时就医，进行口腔检查和诊断。医生可能会根据具体情况采取以下治疗措施：
1.局部治疗：包括洁治、刮治等，以去除牙结石和菌斑，控制炎症。
2.药物治疗：根据病情的严重程度，医生可能会开具口腔漱口水、含片、抗生素等药物进行治疗。
3.对因治疗：如果是智齿冠周炎，可能需要进行智齿拔除；如果是其他疾病引起的，需要针对病因进行治疗。
4.调整饮食：避免食用辛辣、刺激性食物，多吃蔬菜水果，保持口腔清洁。
5.定期口腔检查：定期进行口腔检查，及时发现和处理口腔问题。
需要注意的是，以上内容仅供参考。具体治疗方案应根据个人情况和医生的建议进行选择。