手足口病目前没有特效的抗病毒药物，主要是对症治疗。一般来说，可使用一些缓解症状的药物。比如，发热时如果体温超过38.5℃，可以使用对乙酰氨基酚等退烧药来帮助降温。
对症治疗的药物情况
退热药物： 当患儿体温高于38.5℃时，常用对乙酰氨基酚来进行退热。对乙酰氨基酚能通过抑制前列腺素的合成，达到解热镇痛的作用，一般适用年龄较广，但要注意按照患儿体重等准确用药。缓解口腔疼痛药物： 手足口病患儿口腔会有疱疹，可能引起疼痛影响进食，可使用康复新液等，它能促进黏膜修复，减轻口腔创面的疼痛不适。也可以用淡盐水漱口，保持口腔清洁，在一定程度上缓解疼痛。
抗病毒药物的使用情况
一般不常规使用抗病毒药物： 目前对于普通的手足口病患儿，不推荐常规使用抗病毒药物。因为大多数手足口病是由肠道病毒引起的自限性疾病，病程一般在1 - 2周左右，即使不用特殊抗病毒药物，也能自行恢复。但对于重症高危人群，如3岁以下、有基础疾病等情况的患儿，医生可能会根据情况评估是否使用抗病毒药物，比如使用干扰素等，但这需要严格把握适应证。
护理方面的重要性
隔离与休息： 患儿需要隔离，一般隔离2周左右，避免交叉感染。同时要让患儿多休息，保证充足的睡眠，有利于身体恢复。饮食调整： 给予患儿清淡、易消化的流质或半流质饮食，如米粥、面条等，避免食用辛辣、刺激性、过烫的食物，防止加重口腔疼痛。