吃紧急避孕药可能会带来一些危害，比如约10% - 20%的女性可能会出现月经紊乱，表现为月经提前或推迟。
月经方面的影响
月经提前： 服用紧急避孕药后，体内激素水平骤变，可能打乱正常的月经周期，导致月经提前到来，提前时间可能在3 - 7天左右，甚至更久。月经推迟： 也有部分女性会出现月经推迟的情况，如果推迟超过1周，就要考虑是否避孕失败怀孕了，需要用试纸检测或去医院检查。
胃肠道反应方面
恶心呕吐： 约有50%左右的人会出现恶心症状，其中大概20%的人会伴随呕吐。一般在服药后的几小时内出现，症状较轻的可能只是感觉胃部不适，严重的可能会把吃进去的食物全部吐出，这会影响药物的吸收效果。食欲不振： 服用紧急避孕药后，有些人会在接下来的1 - 2天内食欲明显下降，不想吃东西，影响正常的营养摄入。
对内分泌的影响
激素波动： 紧急避孕药主要成分是左炔诺孕酮，它会使体内雌激素、孕激素水平短时间内大幅升高，然后迅速下降，这种剧烈的激素波动可能会影响卵巢的正常功能，长期多次服用可能会对卵巢储备功能产生不良影响，增加未来出现月经不调、不孕等问题的风险。影响排卵： 部分女性服用后可能会干扰正常的排卵过程，有的本应在当月排卵的，可能会出现排卵延迟或者不排卵的情况，从而影响受孕几率。
其他可能的影响
乳房不适： 少数人会出现乳房胀痛的情况，一般持续1 - 2天，乳房可能会有触痛感，不过这种情况通常会自行缓解。头晕乏力： 大概有10%左右的人会有头晕症状，同时感觉身体乏力，影响日常的工作和生活，一般在服药后1 - 2天内会逐渐减轻，但也有个别人会持续时间稍长一些。