吃紧急避孕药可能会带来一些危害。一般来说，紧急避孕药一个月经周期内最好只吃一次，一年内服用不宜超过3次。
月经紊乱方面
经期改变： 服用紧急避孕药后，约有10%的人会出现经期提前或推迟的情况。比如本应28天左右来一次月经的女性，可能会提前3 - 7天来，或者推迟3 - 10天。经量变化： 部分人会出现经量增多或减少的现象。经量增多时可能较平时多1 - 2倍，经量减少则可能只是正常量的1/2左右。
肠胃不适方面
恶心呕吐： 大约有20% - 30%的人服用紧急避孕药后会出现恶心症状，其中约5% - 10%的人会发生呕吐。一般在服药后的1 - 2小时内出现，恶心症状较轻的可能只是感觉胃部不适，严重的会频繁恶心想呕吐。肠胃不适： 除了恶心呕吐，还可能出现腹痛、腹泻等肠胃不适症状。腹痛程度因人而异，有的是轻微隐痛，有的可能较为明显；腹泻一般每天1 - 3次，多为稀便。
内分泌影响方面
激素波动： 紧急避孕药含有大量孕激素，会影响人体自身的激素平衡。服用后可能导致体内雌激素、孕激素水平短时间内大幅波动。比如雌激素水平可能在服药后几天内较正常情况升高约30%左右，孕激素水平也会有明显变化。影响排卵： 它可能会干扰正常的排卵功能，使排卵时间发生紊乱。有的女性本来规律的排卵周期被打乱，可能在服药后一段时间内无法正常排卵，影响受孕或月经周期的规律性。