孕妇患有甲减对胎儿的影响较大。研究表明，孕妇甲减可能使胎儿智力发育受影响，增加早产、流产等风险，还可能导致胎儿生长受限等。
对胎儿智力发育的影响
胎儿神经系统发育阶段： 在胎儿神经系统发育的关键时期，如妊娠早期（怀孕前3个月），胎儿自身合成甲状腺激素能力很弱，主要依赖母体供应。孕妇甲减会导致母体甲状腺激素水平不足，而甲状腺激素对胎儿大脑发育至关重要，缺乏甲状腺激素可能影响胎儿神经元的迁移、分化等过程，有研究显示，未经治疗的孕妇甲减，胎儿出生后智力发育指数可能比正常孕妇所生胎儿低7 - 8分。持续影响阶段： 即使在妊娠中晚期，母体甲减仍可能对胎儿的认知功能、注意力、记忆力等方面产生长期潜在影响，增加胎儿出现学习困难等问题的几率。
对胎儿生长发育的影响
影响胎盘功能： 甲状腺激素参与胎盘的物质交换等功能调节，孕妇甲减时，甲状腺激素水平异常会干扰胎盘的正常功能，使得胎盘向胎儿输送营养物质和氧气等的能力下降。例如，可能导致胎儿获取的营养不足，影响胎儿的体重增长，使胎儿出生体重低于正常胎儿，增加低出生体重儿的发生率。骨骼发育受影响： 甲状腺激素对胎儿骨骼的生长和成熟也有作用，孕妇甲减可能导致胎儿骨骼发育迟缓，影响胎儿的身高增长等，出生后可能存在体格发育相对落后的情况。
增加妊娠并发症风险
早产风险升高： 孕妇甲减会使体内内分泌环境紊乱，影响子宫的内环境稳定，研究发现，患有甲减的孕妇早产发生率比正常孕妇高出约10% - 15%。流产风险增加： 甲状腺激素水平异常可能影响胚胎的着床和发育，孕妇甲减时流产的风险明显增加，有数据统计，甲减孕妇流产率较正常孕妇可高出2 - 3倍。妊娠期高血压疾病风险： 孕妇甲减还可能增加妊娠期高血压疾病的发生风险，这会进一步影响母婴的健康，对胎儿的生长发育和孕妇的身体状况都带来不利影响。