尿痛尿不干净有刺痛感，通常由以下原因引起：
一、泌尿系感染：
1.当泌尿系统发生感染，比如肾盂肾炎、输尿管炎、膀胱炎、尿道炎时，患者就会出现尿频、尿急、尿痛等尿路刺激症状。
2.建议患者前往医院进行尿液常规以及细菌学检查，明确病因后，配合抗生素进行抗炎治疗，同时也可以口服具有清热解毒、利尿通淋作用的中成药。
二、尿道结石：
1.尿道结石不仅会带来排尿刺痛感，还会伴有排尿困难、排尿分叉等情况，甚至可能出现排尿时尿道口流血。
2.患者需到医院做B超检查，若明确有结石梗阻，建议进行尿道探查，实施结石碎石取出手术以解除梗阻，否则易继发急性尿道感染，甚至可能导致患者发热。
三、其他疾病：
1.尿痛尿不干净是多种疾病的共有症状，如前列腺炎、前列腺增生、精囊炎、膀胱结核，以及尿道的息肉、肿瘤等疾病，也会出现排尿有刺痛感，且可能有血尿、排尿困难等状况。
2.需借助尿道镜检查，查看相应部位是否存在异常病变，并依据具体原因采用合适的方法进行治疗。
此外，平时要增加水分的摄入，确保每天有1500毫升以上的水分，通过大量排尿来冲刷尿道，这有助于减轻感染或帮助排石。其次要注意休息，避免食用辛辣刺激性食物。
总结：尿痛尿不干净且有刺痛感可能由多种原因导致，包括泌尿系感染、尿道结石以及其他多种疾病。明确原因后需采取相应治疗措施，同时要保证水分摄入和注意休息、饮食等方面。