多囊卵巢综合征的引起原因目前尚未完全明确，一般认为是遗传因素和环境因素相互作用所致。有研究显示，约60%~70%的患者存在遗传易感性。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么女性成员患病的风险会增加。例如，母亲患有多囊卵巢综合征，其女儿患多囊卵巢综合征的概率比正常人群高出2~4倍。遗传因素可能通过影响内分泌系统的相关基因，使个体更容易出现激素分泌紊乱等情况，从而增加患多囊卵巢综合征的几率。
内分泌因素影响
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）脉冲频率异常，会导致垂体分泌的促黄体生成素（LH）和促卵泡生成素（FSH）比例失调，通常表现为LH水平升高，FSH水平相对正常或偏低。这种失衡会影响卵巢的正常排卵功能，使卵泡不能正常发育成熟并排卵，进而引发一系列症状，如月经不调、不孕等。胰岛素抵抗与高胰岛素血症： 约50%~70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗。胰岛素抵抗是指机体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多的胰岛素，导致高胰岛素血症。高胰岛素血症会刺激卵巢间质细胞和卵泡膜细胞分泌雄激素，雄激素水平升高又会进一步抑制卵泡发育，加重排卵障碍，同时还可能引起体重增加等问题。
环境因素作用
生活方式因素： 长期的高热量饮食、缺乏运动等不良生活方式是引发多囊卵巢综合征的重要环境因素。例如，经常摄入高糖、高脂肪的食物，会导致体重超标，而肥胖又会加重胰岛素抵抗，进一步影响内分泌系统的平衡。缺乏运动也会使身体代谢减慢，激素调节紊乱，增加患病风险。精神压力因素： 长期处于高压力状态下，会影响神经内分泌系统的功能。例如，持续的精神紧张会促使下丘脑 - 垂体 - 肾上腺轴分泌过多的皮质醇等应激激素，干扰下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常调节，导致激素分泌异常，增加多囊卵巢综合征的发病风险。