多囊卵巢综合征的发病原因目前尚未完全明确，一般认为可能与遗传因素、内分泌失调以及生活方式等多方面有关。比如，有研究发现约60% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在遗传易感性。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么女性成员患病的风险会相对增加。这是因为遗传基因可能会影响到内分泌系统的调节机制，使得个体更容易出现激素分泌失衡的情况。例如，某些特定的基因变异可能会干扰下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常功能，导致雄激素水平升高、排卵异常等多囊卵巢综合征的典型表现。单基因遗传可能性： 部分研究提示，可能存在单基因遗传的情况。不过目前对于具体是哪些单基因以及其确切的遗传方式还在进一步研究中，但可以确定遗传因素在多囊卵巢综合征的发病中起到了重要作用。
内分泌失调方面
下丘脑 - 垂体功能异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）以及垂体分泌的促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）失衡是关键。正常情况下，FSH和LH保持着相对稳定的比例来调节卵巢的排卵功能。但在多囊卵巢综合征患者中，往往出现LH水平升高、FSH水平相对不足的情况，这种失衡会导致卵巢内卵泡发育异常，不能正常排卵，进而引发一系列症状。比如，LH水平升高会刺激卵巢间质和卵泡膜细胞分泌过多的雄激素，使得患者出现多毛、痤疮等高雄激素表现。胰岛素抵抗因素： 约50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗。胰岛素抵抗是指机体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多的胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症又会刺激卵巢分泌更多的雄激素，同时还会影响肝脏合成性激素结合球蛋白，使得游离雄激素水平升高，进一步加重内分泌紊乱，促进多囊卵巢综合征的发展。
生活方式方面
饮食不规律： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食结构可能会影响内分泌系统。例如，过多摄入高糖食物会导致血糖波动较大，容易引发胰岛素抵抗，进而增加多囊卵巢综合征的发病风险。而且营养不均衡也可能影响激素的正常合成和代谢。缺乏运动： 缺乏体育锻炼会使身体的代谢率降低，脂肪更容易堆积。肥胖又是多囊卵巢综合征的一个重要危险因素，肥胖者体内脂肪细胞会分泌更多的瘦素、雌激素等物质，影响内分泌平衡，导致激素失调，增加患病几率。长期精神压力大： 长期处于高压力状态下，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，导致激素分泌紊乱。例如，长期精神紧张可能会促使肾上腺分泌更多的皮质醇等应激激素，干扰正常的内分泌调节，从而增加多囊卵巢综合征的发病可能性。