卵巢隐隐作痛可能由多种原因引起。比如盆腔炎就可能导致这种情况，盆腔炎是女性上生殖道感染引起的一组疾病，其中慢性盆腔炎患者常出现下腹部坠胀、疼痛及腰骶部酸痛，疼痛可在劳累、性交后及月经前后加剧。
妇科炎症引发
盆腔炎：除了上述表现，盆腔炎还可能伴有阴道分泌物增多、异常阴道出血等症状。一般通过妇科检查、B超等可以辅助诊断。附件炎：附件包括卵巢和输卵管，附件炎时卵巢周围组织发炎，也会引起卵巢隐隐作痛，常表现为下腹部双侧或单侧疼痛，伴有发热、白带增多等情况。
卵巢自身病变
卵巢囊肿：较小的卵巢囊肿可能没有明显症状，当囊肿增大或发生扭转、破裂时，就会出现卵巢部位隐隐作痛，甚至突发剧烈疼痛。比如卵巢巧克力囊肿，是子宫内膜异位到卵巢形成的，与月经周期相关，会有进行性加重的痛经等表现。卵巢肿瘤：早期卵巢肿瘤可能无明显症状，随着肿瘤生长，可能出现腹部隐痛、胀满感等，若肿瘤发生恶变或扭转，疼痛会加剧。
生理期因素
排卵期腹痛：部分女性在排卵期会出现一侧下腹隐隐作痛，这是因为卵泡破裂，少量卵泡液刺激腹膜引起的，一般疼痛较轻微，持续1 - 2天可自行缓解。经期腹痛：有些女性在经期会有卵巢部位的隐隐不适，尤其是原发性痛经的女性，可能与前列腺素分泌增多，导致子宫收缩过强，牵连卵巢部位引起疼痛有关。
其他因素
肠道疾病：如乙状结肠炎、直肠炎等，有时疼痛可能会放射到下腹部，容易被误认为是卵巢隐隐作痛，这类疾病还常伴有腹泻、便秘、大便性状改变等症状。泌尿系统疾病：输尿管结石等泌尿系统疾病也可能引起下腹部疼痛，可伴有尿频、尿急、尿痛等症状，通过尿常规、泌尿系B超等检查可鉴别。