肺隔离症主要通过手术治疗，确诊后一般建议尽早手术，尤其是有症状或并发症的患者。手术方式主要有两种，一种是肺叶切除术，适用于病变较局限的情况；另一种是肺隔离症病灶切除术，适用于病变范围较小的患者。
手术治疗的适用情况
先天性肺隔离症：如果患者出现反复肺部感染、咯血等症状，通常需要考虑手术。一般建议在确诊后，若无手术禁忌证，尽早进行手术干预，以防止病情反复加重。比如儿童患者若有相关症状，符合手术条件就应及时手术。获得性肺隔离症：对于由其他因素导致的肺隔离症，若出现明显临床症状，也需通过手术解决问题。像因肺部血管异常等引发相关症状时，手术是主要的治疗手段。
非手术治疗的情况
无症状的肺隔离症：如果患者没有任何症状，且病变非常局限，暂时可以不进行手术，但需要定期随访观察。一般建议每6~12个月进行一次胸部影像学检查，如胸部CT等，密切关注病变的变化情况。如果在随访过程中病变没有变化，可继续观察；若出现变化则考虑手术。身体状况不允许手术的患者：对于一些年老体弱、合并多种严重基础疾病，无法耐受手术的患者，可以采取非手术治疗。例如患者有严重的心脑血管疾病，手术风险极高时，可先针对肺部感染等并发症进行保守治疗，控制感染等症状，但这只是暂时缓解，病情可能会反复。
术后注意事项
呼吸功能锻炼：患者术后需要进行呼吸功能锻炼，比如深呼吸、有效咳嗽咳痰等。一般术后第一天就可以开始进行简单的深呼吸练习，每天可进行3~4次，每次10~15分钟。通过呼吸功能锻炼有助于促进肺复张，减少肺部并发症。切口护理：要注意手术切口的护理，保持切口清洁干燥，避免感染。如果切口出现红、肿、热、痛或有渗液等情况，应及时告知医生进行处理。通常术后10~14天进行切口拆线。定期复查：患者术后需要定期复查，一般在术后1个月、3个月、6个月进行胸部CT等检查，了解肺部恢复情况以及有无复发等。通过定期复查可以及时发现问题并进行处理。